MySQL实例crash的案例详细分析

【问题描述】

我们生产环境有一组集群的多台MySQL服务器(MySQL 5.6.21)，不定期的会crash，但error log中只记录了重启信息，未记录crash时的堆栈：

  mysqld_safe Number of processes running now: 0  mysqld_safe mysqld restarted

接下来首先排查系统日志/var/log/message文件，crash时没有其他异常信息，也不是OOM导致的。

【排查思路】

由于日志中未记录有价值的信息。为定位crash的原因，首先开启mysql core dump的功能。

下面是开启core dump的步骤：

1、 在my.cnf文件中增加2个配置项

  [mysqld]    core_file    [mysqld_safe]    core-file-size=unlimited

2、修改系统参数，配置suid_dumpable

  echo 1 >/proc/sys/fs/suid_dumpable

3、重启mysql服务，配置生效

【问题分析】

开启core dump后，服务器再次crash时生成了core file。

用gdb分析生成的core file，可以看到crash时的堆栈信息如下：

从函数table_esms_by_digest::delete_all_rows可以看出触发crash的是truncate table events_statements_summary_by_digest操作。

我们内部有个DML的分析工具，用来统计数据库每分钟增删改查的访问量。该工具的数据源是events_statements_summary_by_digest表，采集程序会每一分钟采集一次这张表的数据，采集完成后执行truncate操作。

暂停这组集群上DML采集程序后MySQL没有再发生crash。

进一步分析多个core file，发现最终函数的调用都发生在_lf_pinbox_real_free函数上。

结合现场环境，有两处地方值得分析：

1、 内存的不正常值。当打印该变量时，此处变量的地址偏低，不太正常：

  (gdb) p pins->pinbox    $2 = (LF_PINBOX *) 0x1367208

2、红字部分为pfs逐条释放digest记录的操作，正在释放某行数据时出现错误：

  void reset_esms_by_digest()    {    uint index;    if (statements_digest_stat_array == NULL)    return;    PFS_thread *thread= PFS_thread::get_current_thread();    if (unlikely(thread == NULL))    return;    for (index= 0; index < digest_max; index  )    {    statements_digest_stat_array[index].reset_index(thread);    statements_digest_stat_array[index].reset_data();    }    digest_index= 1;    }

猜测有两种可能导致错误：

1、高并发下，对内存访问出现冲突；

2、某个特殊SQL导致，在处理hash时。

在网上搜索类似的问题，有了进一步的进展，基本确定了这个问题是bug导致

如下Mysql的bug report中讲述了类似问题

https://bugs.mysql.com/bug.php?id=73979

更详细的环境描述如下连接中

https://bugs.launchpad.net/percona-server/ bug/1351148

查到5.6.35上的bug fix的修复内容，和我们碰到的情况非常类似。

对比_lf_pinbox_real_free的修改，该部分确实进行很大的调整。

下面是MySQL 5.6.35函数_lf_pinbox_real_free的代码片段：

  static void _lf_pinbox_real_free(LF_PINS pins)    {    LF_PINBOX pinbox= pins->pinbox;    struct st_match_and_save_arg arg = {pins, pinbox, pins->purgatory};    pins->purgatory= NULL;    pins->purgatory_count= 0;    lf_dynarray_iterate(&pinbox->pinarray,    (lf_dynarray_func)match_and_save, &arg);    if (arg.old_purgatory)    {    void *last= arg.old_purgatory;    while (pnext_node(pinbox, last))    last= pnext_node(pinbox, last);    pinbox->free_func(arg.old_purgatory, last, pinbox->free_func_arg);    }    }

下面是MySQL 5.6.21函数的_lf_pinbox_real_free的代码片段

  static void _lf_pinbox_real_free(LF_PINS pins)    {    int npins;    void list;    void **addr= NULL;    void first= NULL, last= NULL;    LF_PINBOX pinbox= pins->pinbox;    npins= pinbox->pins_in_array 1;    if (pins->stack_ends_here != NULL)    {    int alloca_size= sizeof(void )LF_PINBOX_PINSnpins;    if (available_stack_size(&pinbox, *pins->stack_ends_here) > alloca_size)    {    struct st_harvester hv;    addr= (void **) alloca(alloca_size);    hv.granary= addr;    hv.npins= npins;    _lf_dynarray_iterate(&pinbox->pinarray,    (lf_dynarray_func)harvest_pins, &hv);    npins= hv.granary-addr;    if (npins)    qsort(addr, npins, sizeof(void *), (qsort_cmp)ptr_cmp);    }    }

同时观察到出问题的集群有指标异常，QPS不到6000，Threads_connected将近8000。（对比其他高并发的集群，QPS在20000以上，Threads_connected也只有300左右）。

排查应用端的连接方式，了解到其中一个应用有近百台应用服务器，可能同时发起请求，却没有合理的复用连接，维持大量的连接线程增大了bug触发的概率。

Bugs Fixed的描述如下：

Miscalculation of memory requirements for qsort operations could result in stack overflow errors in situations with a large number of concurrent server connections. (Bug #73979, Bug #19678930, Bug #23224078)

【解决思路】

我们通过分析crash时的core file文件，找到crash时的触发条件，暂停DML采集程序（truncate table events_statements_summary_by_digest操作）后恢复。

后面了解到这是MySQL的一个bug，在MySQL 5.6.35版本后已修复。这个bug在应用端与数据库建立大量的连接时，更容易触发。